ISO22000认证适用于整个食品供应链中所有的组织，包括饲料加工，初级产品加工，食品的制造、运输和储存，以及零售业和饮食业。另外，与食品生产紧密关联的其它组织也可以采用该标准，如食品设备的生产，食品包装材料的生产，食品清洁剂的生产，食品添加剂的生产和其它配料的生产等。
        企业申请ISO22000认证应满足几个基本条件：
1、产品生产企业应为有明确法人地位的实体，产品有注册商标，质量稳定且批量生产；
2、企业应按GMP和ISO22000管理体系的要求建立和实施了食品安全管理体系，并有效运行;
3、企业在申请ISO22000认证前，ISO22000体系应至少有效运行3个月，至少做过一次内审，并对内审中发现的不合格实施了确认、整改和跟踪验证。
        在正式申请ISO22000认证时，申请者应按认证机构的要求填写申请表，提交食品安全管理手册、程序文件、SSOP、ISO22000计划书及其他有关证实材料供认证机构文件审查，文件审查主要看企业编写的体系文件能否满足相关认证标准的要求，卫生控制程序（SSOP）能否GMP的要求，ISO22000计划书制定的是否合理，危害分析是否充分等。
        签定ISO22000认证合同后，认证机构一般按如下流程审核：组成审核组、文件审核、初访或预审核、现场审核前的准备、现场审核并提交报告。还需要进行产品型式检验，认证机构审查提交的质量体系审核报告和产品型式检验报告后，编写产品质量认证综合的报告，提交认证机构的技术管理委员会审批，作出是否批准认证的决定。
        食品企业通过ISO22000认证后还应接受认证机构的监督和复评，认证机构可确定对获证企业以ISO22000为基础的食品安全体系进行监督审核，通常为半年一次（季节性生产在生产季节至少每季度一次），每年对供方全部质量体系进行一次复评。